電噴發動機點火系統的結構和工作原理比傳統的觸點式點火系統或天觸點電子點火系統要復雜的多，其不能點火故障原因的范圍也比較廣。為了僅于查找和分析故障原因，可將其分為高壓電路故障和低壓電路故障兩類。
1.高壓電路故障
電噴發動機點火系統的高壓電路和傳統點火系統的高壓電路基本相同，主要由點火線圈、分電器、高壓線、火花塞等組成，其故障原因和傳統點火系to相似，主要有:
(1)高壓線圈次級繞組斷路或短路，使之無法在點火控制器的控制下將伯壓電源轉換成高壓;
(2)分電器的分火頭或分電器蓋漏電，使點火線圈產生的高壓電在送至各缸火花塞之前中途搭鐵;
(3)高壓線斷路，使點火線圈產生的高壓電無法到達火花塞。
2.低壓電路故障
電噴發動機點火系統的復雜之處主要在低壓電路，它是發動機電控系統的一個組成部分。要使點火系統的低壓電路能正常工作，除了點火線圈及點火控制器的電源電路必需正常外，還要求發動機控制系統的電源電路也能正常供電，且控制系統中有關點火控制的部分能正常工作。由于發動機電控系統具有一定的失效保護功能，因此除了曲軸位置傳感器之外，其他的傳感器故障均不會導致不點火故障。只要曲軸位置傳感器能正常產生信號并送入發動機電腦，發動機電腦能發出點火控制信號并送入點火控制器，點火控制器就應能控制點火線圈產生高壓電。因此，電噴發動機點火系統低壓電路故障的范圍主要在曲軸位置傳感器及其線路、發動機電腦及其線路、點火控制器及其線路3個方面。其
故障的原因有:
(1)高壓線圈電源線路斷路或短路;
(2)高壓線圈初級繞組斷路或短路;
(3)曲軸位置傳感器信號不正常;
(4)曲軸位置傳感器到發動機電腦的線路斷路、短路或接觸不良;
(5)點火控制器故障;
(6)點火控制器電源線路斷路或短路;
(7)點火控制器搭鐵線路斷路:
(8)發動機電腦到點火控制的線路斷路;
(9)發動機電腦電源線路斷路或短路;
(10)發動機電腦搭鐵線路故障;
(11)發動機電腦故障。
